الأمانة العامة هي الجهاز الفني والإداري للاتحاد و مقرها تونس. يتولى الامين العام تدبير شؤون الاتحاد ويضع حيز التطبيق قرارات الجمعية العامة ومجلس الإدارة و يمثل الاتحاد لدى الغير و يتعاقد باسمه حسب المقتضيات المنصوص عليها في التنظيمات الجاري العمل بها.